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的聚类结果呈现出显着的组

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发表于 2023-7-15 14:34:56 | 显示全部楼层 |阅读模式
外显子在小脑中有两种剪接模式,而在大脑中只有一种剪接模式(图S 19 A)。另一方面,CADM3基因的外显子2(在大脑和小脑中有两种剪接模式,但两种组织中的Ψ值有显着差异(图S 19 B) )。 进化古老的AS事件在哺乳动物进化枝中具有高剪接熵 通过比较不同剪接年龄事件的 Ψ 值,获得了有价值的见解 [ 11 , 12]。我们询问剪接复杂性的进化

动力学是否也可以用来揭示替代外显子的进化规则。为此,比较了人类中不电话号码数据库同剪接年龄的外显子。为简单起见,以下比较分析仅限于在所有七个物种中具有一对一直向同源物并且在至少一个所研究物种中选择性剪接的CE节点。基于22,294个直系同源外显子(在5,255个一对一直系同源基因中)的Ψ值的聚类分析概括了之前的发现,即外显子

的剪接呈现出物种主导的聚类模式,即来自物种内不同组织的外显子表现出更多的聚类模式。不同物种间匹配组织的 Ψ 值相似(图 S 20A)。当使用同一组CE事件的剪接熵进行聚类时,获得了类似的模式(图S 20 B)。更重要的是,使用在所有七个物种中保守剪接的 251 个 CE 节点(在 204 个一对一直系同源基因中)的 Ψ 值进行



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